Obohatenie štúdie vyžadujú výpočet sekvenčných dát na určenie úrovne pokrytia . To sa deje predovšetkým sekvenovanie génu laboratóriami , ktoré vyžadujú integrovanú prípravu vzoriek DNA a pre- obohacovanie združovania . Výpočet sekvenčné pokrytie vyžaduje použitie premenných , ktoré zahŕňajú sekvenčné pokrytie strednej , celkové cielené základy a účinnosť obohacovanie . Prevedenie tohto výpočtu sa vykonáva vložením všetkých týchto premenných do rovnice . Návod
Stránka 1
Napíš rovnicu používanou na výpočet strednej sekvenčné pokrytie . To bude vyzerať požadované pokrytie delený priemerným normalizovaným pokrytie . V prípade , že požadované krytie je 10x a priemer normalizovanej pokrytie je 0,2 , potom priemerná sekvenčné pokrytie je 50.
2
Napíš rovnicu používanou na výpočet množstva sekvenovania . To bude vyzerať ( celkom cielených báz ) ( stredná sekvenčné pokrytí ) /(účinnosť obohatenie ) = množstvo sekvenovania .
3
Zapojte 62MB pre “ plnej cieľovej základne “ a 0,65 pre “ obohatenie účinnosť. “ Pridať čiastku sekvenčné pokrytie 50x a rovnica bude vyzerať (62) (50) /0.65 . Výsledok rovnice bude 4,8 GB sekvenčných údajov .