? Zvyčajne každá molekula DNA vnútri vašich buniek obsahuje dva prvky spolu spojené interakcií tzv vodíkové väzby . Zmena podmienok však môže “ denaturácii “ DNA a spôsobiť , že tieto prvky oddeliť . Pridanie silné bázy , ako je NaOH , výrazne zvyšuje hodnotu pH , čo znamená zníženie koncentrácie vodíkových iónov v roztoku a denaturácii dvojvláknovej DNA . Vplyv pH
hydroxidu koncentrácie iónov a pH majú priamy vzťah , čo znamená , že vyššie pH , vyššia koncentrácia hydroxidu . Rovnako tak , že čím nižšia je koncentrácia vodíkových iónov padá . Pri vysokej hodnote pH , potom sa roztok je bohatá na hydroxidové ióny , a tieto záporne nabité ióny môže vytiahnuť vodíkové ióny z molekúl , ako sú páry báz v DNA . Tento proces naruší vodíkové väzby , ktoré držia dva reťazce DNA spolu , prinútiť ich , aby oddelenie .
RNA vs DNA
Na rozdiel od RNA , DNA chýba hydroxylové skupiny na pozície 2 “ v každej skupine cukru . Tento rozdiel je DNA oveľa stabilnejšie v alkalickom roztoku . V RNA , hydroxylovú skupinu na pozícii 2 ‚ môže vzdať ión vodíka do roztoku pri vysokej hodnote pH , vytvára vysoko reaktívne alkoxide ióny , ktoré útočia na fosfátovú skupinu drží dvoch susedných nukleotidov dohromady . DNA nie je trpí touto chybou , a preto má pozoruhodnú stabilitu pri vysokej hodnote pH .
Alkalické lýzy
Molekulárna biológovia často využívajú alkalické denaturácia izolovať plazmid DNA z baktérií . Plazmidy sú malé slučky DNA oddeľujú od bakteriálneho chromozómu . V alkalickej lýzy Miniprep , biológovia pridať prací prostriedok a hydroxid sodný pre baktérie suspendované v roztoku . Detergent rozpúšťa bakteriálnej bunkovej membrány , zatiaľ čo hydroxid sodný zvyšuje pH a je vysoko alkalický roztok . Vzhľadom k tomu , rozbité bunky uvoľňujú svoj obsah , DNA vnútri rozdelí na jednotlivé pramene , alebo denaturuje .
Reannealing
Po biológ extrahuje DNA z bunky , sa pridáva ďalšie činidlá vrátiť riešenie viac neutrálnym pH a vyzrážanie detergent . Zmena pH umožňuje plazmidmi prvky na reanneal ; objemný chromozóm , ale nemôže robiť to isté , tak biológ ho odstrániť spolu s pracím prostriedkom , denaturované proteíny a iné rozmanité haraburdie , takže plazmid za sebou . Alkalické lýzy nie je úplne čistí plazmidmi DNA ; skôr , že slúži ako “ rýchle a špinavé “ spôsob , ako extrahovať z bunky a odstrániť väčšinu iné nečistoty .